Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL41O60662 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms