Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLIN1O60240 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms