Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDE6DO43924 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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PDE6DO43924 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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PDE6DO43924 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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PDE6DO43924 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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PDE6DO43924 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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PDE6DO43924 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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PDE6DO43924 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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PDE6DO43924 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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PDE6DO43924 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PDE6DO43924 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDE6DO43924 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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