Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VEGFDO43915 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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VEGFDO43915 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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VEGFDO43915 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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VEGFDO43915 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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VEGFDO43915 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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VEGFDO43915 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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VEGFDO43915 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VEGFDO43915 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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