Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA3O43365 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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