Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
GPAA1O43292 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPAA1O43292 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPAA1O43292 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPAA1O43292 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPAA1O43292 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPAA1O43292 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GPAA1O43292 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPAA1O43292 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPAA1O43292 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPAA1O43292 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPAA1O43292 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPAA1O43292 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPAA1O43292 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPAA1O43292 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPAA1O43292 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPAA1O43292 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPAA1O43292 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPAA1O43292 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPAA1O43292 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPAA1O43292 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPAA1O43292 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GPAA1O43292 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPAA1O43292 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPAA1O43292 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPAA1O43292 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPAA1O43292 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPAA1O43292 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms