Protein–RNA interactions for Protein: O15541

RNF113A, RING finger protein 113A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF113AO15541 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF113AO15541 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF113AO15541 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF113AO15541 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF113AO15541 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF113AO15541 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
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