Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SETD1AO15047 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SETD1AO15047 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms