Protein–RNA interactions for Protein: O15013

ARHGEF10, Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10O15013 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARHGEF10O15013 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGEF10O15013 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
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