Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASKO14936 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASKO14936 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CASKO14936 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASKO14936 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASKO14936 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASKO14936 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASKO14936 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASKO14936 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASKO14936 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASKO14936 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASKO14936 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASKO14936 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASKO14936 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASKO14936 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASKO14936 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASKO14936 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASKO14936 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASKO14936 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASKO14936 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASKO14936 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CASKO14936 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASKO14936 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASKO14936 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASKO14936 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASKO14936 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CASKO14936 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASKO14936 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASKO14936 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASKO14936 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASKO14936 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASKO14936 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASKO14936 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASKO14936 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASKO14936 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASKO14936 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASKO14936 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASKO14936 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASKO14936 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASKO14936 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASKO14936 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASKO14936 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASKO14936 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CASKO14936 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASKO14936 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CASKO14936 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASKO14936 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASKO14936 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASKO14936 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASKO14936 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASKO14936 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASKO14936 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASKO14936 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASKO14936 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASKO14936 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CASKO14936 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASKO14936 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASKO14936 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASKO14936 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASKO14936 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASKO14936 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASKO14936 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASKO14936 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASKO14936 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASKO14936 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASKO14936 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASKO14936 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASKO14936 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASKO14936 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASKO14936 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASKO14936 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASKO14936 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASKO14936 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASKO14936 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASKO14936 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASKO14936 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CASKO14936 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASKO14936 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASKO14936 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASKO14936 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASKO14936 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CASKO14936 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASKO14936 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASKO14936 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASKO14936 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASKO14936 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASKO14936 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASKO14936 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASKO14936 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASKO14936 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASKO14936 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASKO14936 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASKO14936 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASKO14936 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASKO14936 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASKO14936 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASKO14936 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASKO14936 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASKO14936 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASKO14936 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms