Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFIT3O14879 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFIT3O14879 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms