Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
POLR3AO14802 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms