Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAFD1O14545 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAFD1O14545 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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