Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SOCS6O14544 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SOCS6O14544 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOCS6O14544 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SOCS6O14544 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOCS6O14544 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOCS6O14544 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOCS6O14544 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOCS6O14544 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOCS6O14544 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOCS6O14544 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOCS6O14544 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOCS6O14544 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOCS6O14544 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOCS6O14544 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOCS6O14544 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOCS6O14544 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SOCS6O14544 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SOCS6O14544 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SOCS6O14544 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SOCS6O14544 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SOCS6O14544 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SOCS6O14544 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SOCS6O14544 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SOCS6O14544 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SOCS6O14544 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SOCS6O14544 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SOCS6O14544 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SOCS6O14544 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SOCS6O14544 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SOCS6O14544 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms