Protein–RNA interactions for Protein: B4DSR2

cDNA FLJ52234, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DSR2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DSR2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DSR2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DSR2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DSR2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DSR2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DSR2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DSR2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DSR2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DSR2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DSR2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DSR2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DSR2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DSR2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DSR2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DSR2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DSR2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DSR2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DSR2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DSR2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DSR2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DSR2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DSR2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DSR2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DSR2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DSR2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DSR2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DSR2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DSR2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DSR2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DSR2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DSR2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DSR2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DSR2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DSR2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DSR2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DSR2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DSR2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DSR2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DSR2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DSR2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DSR2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DSR2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DSR2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DSR2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DSR2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DSR2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DSR2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DSR2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DSR2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DSR2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DSR2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DSR2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DSR2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DSR2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DSR2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DSR2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DSR2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DSR2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DSR2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DSR2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DSR2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DSR2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DSR2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DSR2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DSR2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DSR2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DSR2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
B4DSR2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
B4DSR2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
B4DSR2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
B4DSR2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
B4DSR2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
B4DSR2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
B4DSR2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DSR2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DSR2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DSR2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DSR2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DSR2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DSR2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DSR2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DSR2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DSR2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DSR2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DSR2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DSR2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DSR2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DSR2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DSR2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DSR2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DSR2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DSR2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DSR2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
B4DSR2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DSR2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DSR2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DSR2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DSR2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
B4DSR2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms