Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF839A8K0R7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF839A8K0R7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms