Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRIQ3A6PVS8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRIQ3A6PVS8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRIQ3A6PVS8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRIQ3A6PVS8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRIQ3A6PVS8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRIQ3A6PVS8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRIQ3A6PVS8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRIQ3A6PVS8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRIQ3A6PVS8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRIQ3A6PVS8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRIQ3A6PVS8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRIQ3A6PVS8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRIQ3A6PVS8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRIQ3A6PVS8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRIQ3A6PVS8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRIQ3A6PVS8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRIQ3A6PVS8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRIQ3A6PVS8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRIQ3A6PVS8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRIQ3A6PVS8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRIQ3A6PVS8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRIQ3A6PVS8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRIQ3A6PVS8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRIQ3A6PVS8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRIQ3A6PVS8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRIQ3A6PVS8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRIQ3A6PVS8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRIQ3A6PVS8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms