Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL33A6NCF5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL33A6NCF5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms