Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCHNA4D1U4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms