Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQE9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQE9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQE9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQE9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQE9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQE9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQE9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQE9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQE9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQE9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQE9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQE9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQE9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQE9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQE9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
U3KQE9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQE9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQE9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQE9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQE9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQE9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQE9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQE9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQE9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQE9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQE9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQE9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQE9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQE9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQE9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQE9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQE9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQE9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQE9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQE9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQE9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQE9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQE9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQE9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U3KQE9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQE9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQE9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQE9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQE9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQE9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQE9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQE9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQE9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQE9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQE9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQE9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQE9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQE9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQE9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQE9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQE9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQE9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQE9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQE9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQE9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQE9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQE9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQE9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQE9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQE9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U3KQE9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQE9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQE9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQE9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQE9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQE9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQE9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQE9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQE9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQE9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQE9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQE9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQE9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQE9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U3KQE9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQE9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQE9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQE9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQE9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQE9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQE9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQE9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQE9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
U3KQE9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQE9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQE9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQE9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQE9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQE9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQE9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQE9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQE9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQE9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQE9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms