Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CAMTA1Q9Y6Y1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAMTA1Q9Y6Y1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms