Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6V7

DDX49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX49Q9Y6V7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX49Q9Y6V7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX49Q9Y6V7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX49Q9Y6V7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX49Q9Y6V7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX49Q9Y6V7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX49Q9Y6V7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX49Q9Y6V7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms