Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NRXN3Q9Y4C0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN3Q9Y4C0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms