Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HCN4Q9Y3Q4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HCN4Q9Y3Q4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCN4Q9Y3Q4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCN4Q9Y3Q4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCN4Q9Y3Q4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCN4Q9Y3Q4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCN4Q9Y3Q4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCN4Q9Y3Q4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCN4Q9Y3Q4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCN4Q9Y3Q4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCN4Q9Y3Q4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCN4Q9Y3Q4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCN4Q9Y3Q4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCN4Q9Y3Q4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCN4Q9Y3Q4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HCN4Q9Y3Q4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HCN4Q9Y3Q4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCN4Q9Y3Q4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCN4Q9Y3Q4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HCN4Q9Y3Q4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HCN4Q9Y3Q4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HCN4Q9Y3Q4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HCN4Q9Y3Q4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HCN4Q9Y3Q4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HCN4Q9Y3Q4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms