Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms