Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF13BQ9Y275 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF13BQ9Y275 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms