Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNQ9UQP3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNNQ9UQP3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNNQ9UQP3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNQ9UQP3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNQ9UQP3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNQ9UQP3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNQ9UQP3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNQ9UQP3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNQ9UQP3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNQ9UQP3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNQ9UQP3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNQ9UQP3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNQ9UQP3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNQ9UQP3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNNQ9UQP3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNNQ9UQP3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TNNQ9UQP3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms