Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPS5Q9UPZ3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPS5Q9UPZ3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms