Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGTPBP1Q9UPW5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGTPBP1Q9UPW5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms