Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHA12Q9UN75 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHA12Q9UN75 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms