Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP18Q9UMW8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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