Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ALKQ9UM73 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ALKQ9UM73 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ALKQ9UM73 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ALKQ9UM73 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ALKQ9UM73 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ALKQ9UM73 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ALKQ9UM73 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ALKQ9UM73 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ALKQ9UM73 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ALKQ9UM73 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ALKQ9UM73 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ALKQ9UM73 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ALKQ9UM73 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALKQ9UM73 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALKQ9UM73 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALKQ9UM73 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALKQ9UM73 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALKQ9UM73 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALKQ9UM73 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALKQ9UM73 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALKQ9UM73 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALKQ9UM73 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALKQ9UM73 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALKQ9UM73 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALKQ9UM73 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALKQ9UM73 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALKQ9UM73 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALKQ9UM73 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALKQ9UM73 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ALKQ9UM73 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms