Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDH22Q9UJ99 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDH22Q9UJ99 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms