Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAJB4Q9UDY4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAJB4Q9UDY4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms