Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SPASTQ9UBP0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPASTQ9UBP0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPASTQ9UBP0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPASTQ9UBP0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPASTQ9UBP0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPASTQ9UBP0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPASTQ9UBP0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPASTQ9UBP0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPASTQ9UBP0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPASTQ9UBP0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPASTQ9UBP0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPASTQ9UBP0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SPASTQ9UBP0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPASTQ9UBP0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPASTQ9UBP0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPASTQ9UBP0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPASTQ9UBP0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPASTQ9UBP0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPASTQ9UBP0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPASTQ9UBP0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPASTQ9UBP0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPASTQ9UBP0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPASTQ9UBP0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPASTQ9UBP0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPASTQ9UBP0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPASTQ9UBP0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPASTQ9UBP0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPASTQ9UBP0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPASTQ9UBP0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SPASTQ9UBP0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPASTQ9UBP0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms