Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH10Q9P2E7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH10Q9P2E7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms