Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EHD3Q9NZN3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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