Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL28Q9NXS3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL28Q9NXS3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms