Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT1Q9NXH9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT1Q9NXH9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms