Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CWC25Q9NXE8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms