Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CLN6Q9NWW5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLN6Q9NWW5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLN6Q9NWW5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLN6Q9NWW5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLN6Q9NWW5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLN6Q9NWW5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLN6Q9NWW5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLN6Q9NWW5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLN6Q9NWW5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLN6Q9NWW5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLN6Q9NWW5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms