Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TMEM248Q9NWD8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM248Q9NWD8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM248Q9NWD8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM248Q9NWD8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM248Q9NWD8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM248Q9NWD8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM248Q9NWD8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM248Q9NWD8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM248Q9NWD8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM248Q9NWD8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM248Q9NWD8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM248Q9NWD8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM248Q9NWD8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM248Q9NWD8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM248Q9NWD8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM248Q9NWD8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM248Q9NWD8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM248Q9NWD8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM248Q9NWD8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM248Q9NWD8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM248Q9NWD8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM248Q9NWD8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM248Q9NWD8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM248Q9NWD8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM248Q9NWD8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms