Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVG8

TBC1D13, TBC1 domain family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D13Q9NVG8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBC1D13Q9NVG8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBC1D13Q9NVG8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBC1D13Q9NVG8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D13Q9NVG8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D13Q9NVG8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D13Q9NVG8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D13Q9NVG8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D13Q9NVG8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D13Q9NVG8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D13Q9NVG8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D13Q9NVG8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D13Q9NVG8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D13Q9NVG8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D13Q9NVG8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBC1D13Q9NVG8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBC1D13Q9NVG8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBC1D13Q9NVG8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBC1D13Q9NVG8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TBC1D13Q9NVG8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBC1D13Q9NVG8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TBC1D13Q9NVG8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBC1D13Q9NVG8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBC1D13Q9NVG8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TBC1D13Q9NVG8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TBC1D13Q9NVG8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBC1D13Q9NVG8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBC1D13Q9NVG8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBC1D13Q9NVG8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms