Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GINM1Q9NU53 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GINM1Q9NU53 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms