Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RRP7BPQ9NSQ0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms