Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX6

TMEM167B, Protein kish-B, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM167BQ9NRX6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM167BQ9NRX6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM167BQ9NRX6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM167BQ9NRX6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM167BQ9NRX6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM167BQ9NRX6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM167BQ9NRX6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM167BQ9NRX6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM167BQ9NRX6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM167BQ9NRX6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM167BQ9NRX6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM167BQ9NRX6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM167BQ9NRX6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM167BQ9NRX6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM167BQ9NRX6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM167BQ9NRX6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM167BQ9NRX6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM167BQ9NRX6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM167BQ9NRX6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM167BQ9NRX6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM167BQ9NRX6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM167BQ9NRX6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM167BQ9NRX6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM167BQ9NRX6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM167BQ9NRX6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM167BQ9NRX6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM167BQ9NRX6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms