Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
STRN4Q9NRL3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
STRN4Q9NRL3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
STRN4Q9NRL3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
STRN4Q9NRL3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRN4Q9NRL3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRN4Q9NRL3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms