Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD163L1Q9NR16 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD163L1Q9NR16 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms