Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCG8

CWC22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC22Q9HCG8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC22Q9HCG8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms