Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMYD3Q9H7B4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD3Q9H7B4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms